西北部多为中低山，海拔500～1800米，有千米以上的山峰43座，其中位于莆田市仙游县-永泰县-德化县交界处的石谷解海拔1803米，为市内最高峰 。
最大的平原是兴化平原，俗称南北洋平原，面积4.64万公顷，是福建省第三大平原 。
莆田境内海岸线长达343.6公里，约占福建省海岸线总长的10.3%，东南部为沿海低丘陵带，多半岛、岛屿和海湾，海岸线曲折，长达233.9千米 。拥有湄洲湾、兴化湾、平海湾，其中湄洲湾的秀屿、东吴水深港阔、不冻不淤，三湾之间有埭头半岛、忠门半岛、秀屿半岛 。有大小岛屿150多个，其中以南日岛、湄洲岛及乌丘屿最为著名 。[16]
气候特征
莆田风采
莆田市属海洋性亚热带季风气候，年平均气温18℃-21℃，年均日照时数1995.9小时，无霜期300-350天，年降雨量1000-1800毫米 。
莆田市地处北回归线北侧边缘，东濒海洋，属典型的亚热带海洋性季风气候 。平均年太阳辐射量达110.41千卡/平方厘米；年日照时数平均为1995.9小时，年均日照率为45% 。日照时间从山区至沿海逐步增多 。气温由东南沿海向西北内陆山区逐渐降低 。各地年平均气温在16℃至21℃之间 。无霜期年平均达316天至350天之间 。全市绝大部分土地，适宜农业生产上的一年三熟制作物栽培 。[17]
全市各地年平均降水量在1000毫米至2300毫米之间，自西北山区向东南沿海递减 。西北部山区达2300毫米以上，中部平原为1200毫米至1600毫米，东南部沿海和岛屿在900毫米至1300毫米 。
季风明显，滨海风大也是莆田气候的一个特征 。主要的方向有东北风和西南风；冬、夏季风方向随季节交替而转换明显，冬季多为偏北风，夏季多为东南风，而春、秋季为风向转换季节 。风速自沿海向平原及内地山区减弱，冬季风往往比夏季风强 。
水力资源
莆田境内河流多数自西北向东、南方向流径，主要有木兰溪、延寿溪和萩芦溪三大溪流水系 。
木兰溪发源于德化县戴云山支脉的笔架山，入仙游县西苑乡黄坑村，横贯全市中、南部，自西北向东南流经度尾、大济、鲤城、城东、赖店、盖尾、华亭、城郊、渠桥、黄石、涵江等地区，至三江口注入兴化湾 。干流全长168公里，集雨面积超过2000平方公里，是闽中的最大溪流，为福建省八条主要水系之一 。木兰溪水系的较大支流有延寿溪、中岳溪、大济溪、溪口溪，龙华溪、松板溪，仙水溪、苦溪等 。
延寿溪又称南萩芦溪，源于仙游县钟山镇林泉安，汇九鲤湖溪、莒溪、长岭溪、渔沧溪等溪水，进入莆田平原后，分成众多沟渠，流经常太、城郊和涵江等乡镇，注入木兰溪出海，干、支流总长189公里，集雨面积386平方公里，是木兰溪最大的支流 。萩芦溪源于永泰县和莆田县交界的黄乡，入仙游游洋镇馨角山，汇吉宦溪、湘溪、巩石溪、朱溪、蒜溪等，自东北向东南流经庄边、白沙、秋芦、江口等乡镇，注入兴化湾 。
萩芦溪干支流总长150公里，集雨面积709平方公里（莆田市境内662平方公里），居全省第十一位 。萩芦溪翻山越岭，峡高滩险，水位落差大，庄边溪底高程137.7米，至江口溪底只有7米，水力资源极为丰富 。[16]
植物资源
莆田
截至2009年5月，莆田市境内有215科，1403种 。主要介绍植被、树种、药材、农作物、果树、茶叶、花卉、食用菌等资源 。
植被类型有天然林、人工林、荒草坡、经济林、果树林、海岸植被等 。莆田市的植被分区为“闽东南戴云山东湿润暖亚热带雨林小区” 。其植被段分界线大致为：西起仙游县度尾镇的苦竹村，经度尾中峰桥、大济镇南山、书峰乡书峰村、榜头镇桃源村和九仙寺及天马寺、盖尾镇外坑亭和顶寨里，再转入莆田县华亭镇三紫山、九华山、紫霄峰及萩芦镇崇联、梅洋和友谊村，东至江口镇东方红水库 。此界南海拔400米以下的地带植被属亚热带常绿雨林，界北海拔400米以上的山地丘陵以中亚热带常绿阔叶林为主 。

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